Cerkev je omenjena že v 13. stoletju.

Sedanjo podobo je dobila po številnih prenovitvenih delih leta 1773 ter po temeljiti restavraciji leta 1890.

Posvečena je bila enemu prvih rimskih papežev, sv. Klementu.

Zaradi strahotne kuge, ki je v Istri razsajala v 17. stoletju, so cerkev preimenovali v cerkev sv. Marije Zdravja, ki je bila kakor sv. Rok priprošnjica pred kugo.